污水紫外線消毒器的選型要根據水的性質和每小時所需處理的水的數量來確定。紫外線消毒器的消毒能力是指在額定進水量情況下對水中微生物的殺滅功能。其物理表達式表示在該狀態下的輻照劑量：
W=IXV/Q×3.6；
式中：
W-輻照劑量，µW/(cm2·s)；
I-輻射強度，µW/cm2；
V-消毒器的有效水容積，L；
Q-消毒器的額定進水量，m3/h。
確定污水紫外線消毒器消毒能力的核心問題是如何決定輻照劑量。殺滅不同微生物需要不同的輻照劑量，而存在于水中的微生物是各種各樣的。選定的輻照劑量過高會浪費不必要的能量，過低又達不到消毒的目的。水的消毒應該側重于殺滅通過水污染疾病的腸道細菌，一般認為紫外線消毒器所能提供的輻照劑量不小于9 000µW/(cm2·s)，產品出廠時應大于12 000µW/(cm2·s)。
在紫外線消毒器中各點的紫外線輻射強度是不同的。燈管發出的紫外線穿過石英套管造成一定的衰減，在穿過水層的強度隨水層深度增加而減少，即存在下述關系：
I=I0e-kd；
式中：
I-不同水深的輻射強度，µW/(cm2·s)；
I0-超始輻射強度，µW/(cm2·s)；
k-水層深度，cm；
d-水的吸取系數，cm-1。
式中水的吸取系數依次與濁度、色度、含鐵量有關。
紫外線消毒器中有多只燈管的情況下，筒體斷面內的紫外線輻射強度的分布計算比較復雜，保證各點強度大體一致是結構設計中的主要問題。
在消毒器的有效使用過程中，輻照劑量隨時間的增加而減少，這主要是因為燈管的輻射強度的變化，消毒器筒體內表面和石英套管表面結垢造成紫外線的反射率和透紫降低也是一個重要的原因。
